融合基因在血液腫瘤的診斷、預(yù)后、分層以及治療中均起到重要作用。WHO在2000年發(fā)布的白血病和淋巴瘤診斷標(biāo)準(zhǔn)已將染色體易位后融合基因檢測作為重要的指標(biāo)之一，用于治療方案的確定以及預(yù)后分析。
隨著分子技術(shù)尤其是高通量測序技術(shù)的發(fā)展，大量的血液腫瘤相關(guān)的少見融合基因被發(fā)現(xiàn)。目前臨床上融合基因檢測僅能針對最常見的數(shù)十種融合進行檢測，覆蓋種類尚不足10%，依然存在患者未能準(zhǔn)確分層，遭遇過度治療或治療不足的情況。對于血液腫瘤患者而言，準(zhǔn)確的預(yù)后分層是臨床治愈率能否進一步提高的關(guān)鍵。
如果曾經(jīng)臨床上對如此多變的融合基因檢測覆蓋不全“是不能也，非不為也”，那么優(yōu)睿?血液腫瘤融合基因檢測的出現(xiàn)將全面扭轉(zhuǎn)這種被動局面。
背 景
● 血液腫瘤的治療與分層密不可分
血液腫瘤主要包括各類白血病、多發(fā)性骨髓瘤以及惡性淋巴瘤。目前國際上采用MICM診斷和分型標(biāo)準(zhǔn)，即綜合形態(tài)檢測(Morphology)、免疫檢測(Immunology) 、細胞遺傳學(xué)檢測(Cytogenetics)以及分子檢測(Molecular)的結(jié)果對患者進行診斷、分型及分層。在MICM精準(zhǔn)分型與分層的基礎(chǔ)上，選擇最有效的治療方案，實現(xiàn)精準(zhǔn)治療。
● 融合基因?qū)︻A(yù)后分層至關(guān)重要
隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，對于血液腫瘤的檢測深入到分子層面。大家逐漸認(rèn)識到大部分的血液腫瘤中存在著染色體結(jié)構(gòu)畸變(包括缺失、重復(fù)、倒位、易位等)，會導(dǎo)致融合基因的產(chǎn)生以及融合蛋白的編碼。而這些融合基因在血液腫瘤的診斷、預(yù)后、分層以及治療中均起到重要作用。
如BCR-ABL融合基因，可出現(xiàn)在95%以上的慢性粒細胞白血病中(CML)。急性早幼粒細胞白血病(APL)特有的PML-RARa融合基因，用全反式維甲酸(ATRA)誘導(dǎo)緩解治療，其預(yù)后非常好，復(fù)發(fā)率低。而有些融合，如MLL相關(guān)融合基因，預(yù)后差，死亡率高。
● 目前常用融合基因檢測恐難滿足臨床需求
迄今為止報道的融合基因已有千種。僅在一項179例AML患者的NGS研究中，就檢測到了118個融合基因。而在另一項2345例存在MLL基因重排的白血病患者中，通過長片段PCR+測序檢測到MLL的融合伴侶種類多達135種。臨床融合基因檢測中覆蓋種類尚不足10%。而許多少見的融合基因依舊具有明確的臨床價值和意義。
基于AMLSG及Mitelman數(shù)據(jù)庫，下表展示了部分少見融合基因及其對于預(yù)后的影響。
▲Bullinger, Lars, Konstanze D?hner, and Hartmut D?hner. Journal of Clinical Oncology 35.9 (2017): 934-946.
除了對預(yù)后/危險度的精準(zhǔn)分層外，融合基因也會對診斷、靶向治療給予更全面的提升，如在一項154例ph-like B-ALL患者的研究中，62%的患者檢出了35種激酶相關(guān)的融合基因。其中JAK2(10種)、ABL1(6種)、PDGFRB(4種)、ABL2(3種)。而在這類攜帶激酶類重排的患者，采取相應(yīng)的激酶抑制劑進行靶向治療，已經(jīng)有多項此類的臨床試驗在進行。
▲Hematopathology. 2016;1(1):11-15
● 傳統(tǒng)融合基因檢測方法技術(shù)有限
為何目前臨床融合基因檢測僅僅檢查數(shù)十種融合基因呢?而且在整理臨床常用的3家融合基因檢測機構(gòu)的篩查范圍，發(fā)現(xiàn)三者共同篩查的融合的比例僅為55.6%。究其原因，乃是檢測技術(shù)限制所致。
具體說來目前臨床上均是基于多重PCR或熒光PCR原理的融合基因檢測解決方案。此類解決方案需要針對每個融合類型(一種融合基因含有多種融合類型)進行特異的引物設(shè)計。引物設(shè)計以及反應(yīng)體系要求隨著同時檢測的融合斷點數(shù)目增加而增加，因此造成了檢測通量上不去，檢測范圍有差異的現(xiàn)狀。
優(yōu)睿?血液腫瘤融合基因檢測大有可為
為讓臨床能更精準(zhǔn)更全面的檢測融合基因，優(yōu)迅醫(yī)學(xué)研發(fā)了結(jié)合新一代高通量測序技術(shù)(NGS)與探針富集技術(shù)的融合基因檢測方案，突破了PCR融合基因檢測只能檢測已知融合位點的限制，避免了多重PCR引物設(shè)計的約束，將檢測通量提高20倍，真正實現(xiàn)了融合基因的全面檢測，從而將最新的臨床研究成果迅速轉(zhuǎn)化至臨床，實現(xiàn)更加精準(zhǔn)的診斷與預(yù)后/危險度分層，幫助患者選擇更有效的治療方案，達到最大的臨床獲益。
● 優(yōu)睿?血液腫瘤融合基因標(biāo)準(zhǔn)套餐 ●
500+融合(35核心基因)
根據(jù)融合基因的發(fā)生頻率及融合伴侶數(shù)目，精選35個血液腫瘤核心基因，涉及已知融合518種。
● 優(yōu)睿?血液腫瘤融合基因標(biāo)準(zhǔn)套餐 ●
900+融合(225基因)
整合NCCN、ELN等指南、權(quán)威數(shù)據(jù)庫及最新科研成果，一次性檢測900+種融合基因，實現(xiàn)融合基因全覆蓋。
適用人群
● 疑似或初診的血液腫瘤患者
● 形態(tài)學(xué)緩解前未做過融合基因篩查的血液腫瘤患者
● 傳統(tǒng)方法未檢測到融合基因的血液腫瘤患者
● 治療效果不佳的血液腫瘤患者
優(yōu)睿?血液腫瘤融合基因檢測可為以上患者提供預(yù)后及危險度分層的精準(zhǔn)評估、血液腫瘤的輔助診斷及分型分層、靶向藥及治療方案(化療、移植等)的決策支持、難治/復(fù)發(fā)患者病因查詢。
檢測周期：自實驗室接收到樣本起，12個工作日。
貼心服務(wù)：若檢測到頻率低于2%的融合基因，優(yōu)迅醫(yī)學(xué)提供免費驗證(報告周期順延)。
重要優(yōu)勢
√ 從根本上解決了常見融合因融合斷點造成的漏檢，相同檢測范圍下的性能提升。
√ 檢測通量提高20倍，涵蓋了已報道的全部融合，且部分拓展到未知融合，檢測范圍大幅提升。
√ 互補核型檢測結(jié)果，降低由于核型主觀性以及其他技術(shù)原因?qū)е碌募訇幮越Y(jié)果。
√ 通過檢測范圍以及性能的大幅提升，最終使得危險度分層更加精準(zhǔn)，從而選擇更有效的治療方案。
√ 增大了檢出微殘檢測(MRD)靶點的可能性。
優(yōu)睿在多大程度上幫助解決了臨床上檢測不足的問題?
● 大幅提高危險度分層準(zhǔn)確率
優(yōu)迅醫(yī)學(xué)對65例(常規(guī)融合檢測陰性)臨床回顧性樣本進行NGS優(yōu)睿?融合基因檢測，共在19例樣本中檢測到融合基因，檢出比例達到29%。對于26例難治患者的危險度分層準(zhǔn)確率，由15%提升至46%。這就意味著對比傳統(tǒng)融合基因檢測方法，8名患者(30%)會受益于優(yōu)睿?融合基因檢測，得到準(zhǔn)確的危險度分層，從而調(diào)整治療方案。
不同預(yù)后組別檢出率
● 大幅降低核型檢測假陰性情況
染色體核型作為目前各大指南危險度分層的重要指標(biāo)，但由于敏感性以及技術(shù)原因會出現(xiàn)一定的假陰性結(jié)果，從而誤導(dǎo)臨床診療。而優(yōu)睿?融合基因檢測可互補核型檢測，降低核型檢測的假陰性情況。通過對34例核型正常的回顧性樣本進行優(yōu)睿?融合基因檢測，12例(35%)患者NGS融合基因檢測為陽性，從而提示該樣本的染色體存在易位。下圖為漏檢核型示例，該患者MLL-SEPT9融合陽性，其對應(yīng)核型應(yīng)為t(11;17)(q23;q25) 。
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